米格爾﹒塞爾韋特是一位生活在十六世紀的基督徒，他激怒了約翰﹒加爾文，并因非法的原因被加爾文與他的親信謀殺。他被指控是異端，通過所謂的審判，被活活燒死在火刑柱上。然而這種暴行卻受到包括海因裏希﹒布林格在內的著名的多代加爾文主義者的贊揚。
以下引用約翰﹒加爾文說的一些毫無悔意的話，承認他在謀殺米格爾﹒塞爾韋特中所扮演的角色。
在這件事發生的七年之前：
“如果他（指塞爾韋特）來（日內瓦），我決不會讓他活著出去，如過我的權威還有份量的話。”
約翰﹒加爾文在1546年2月13日寫給法雷爾的信裏在這件事發生時：
在1553年8月20日一封致法雷爾的信裏，加爾文說他已經讓人逮捕了塞爾韋特。
“現在我們手頭有新事要與塞爾韋特做。他想路過這座城，因為還不知道他想幹什麼。但在他被認出後，我想他應該被拘留。我的朋友尼古拉以死罪傳喚他。……我希望至少給他定死罪。”這件事之後：
“很多人指責我凶狠殘忍，說（他們聲稱）我會把我殺了的那個人再殺一遍。我不但對他們的評論無動于衷，而且我因他們把口水吐在我臉上歡喜快樂。”“無論誰認為殺異端和褻瀆者是不公的，將明知并自愿招致同樣的罪。”
（順便說一下，馬丁﹒路德曾寫到他反對把“異端”殺死。顯然，加爾文在此提倡把路德也殺了。）
加爾文關于塞爾韋特被記錄下來的最強有力陳述是一封加爾文在1561年寫給納瓦拉國王的高管家，帕特侯爵的信，他在信中毫不寬容地說：
“榮譽、榮耀、和財富將是你經受痛苦的賞賜﹔但首先，一定要除掉國家裏的那些惡棍，他們煽動人們反抗我們。這些怪物應該被消滅，就像我消滅米格爾﹒塞爾韋特這個西班牙人一樣。”
關于加爾文這樣的人，經上寫到：“凡恨他弟兄的就是殺人的，你們曉得凡殺人的沒有永生存在他裏面。”【約翰一書 3:15】
在火刑柱上被活活燒死之前，塞爾韋特最後的話是：
“耶穌，永生神的兒子，憐憫我！”
然而，狠心的現代加爾文主義者對此評論說：“這句話集中體現了他關于三位一體的錯誤本質。”因為他說“永生神的兒子”而不是說“神永生的兒子”。
一些把他活活燒死的官方理由是：
- 被控反對嬰兒受洗
- 被控誹謗約翰﹒加爾文
- 被控“長時間”不結婚
- 被控否認三位一體
他對三位一體的立場
（另見 http://www.godglorified.com/michael_servetus.htm）
對三位一體的描述有很多微妙的差別，特別是在當時。在說三位一體時，塞爾韋特所反對的其實是“三神論”。關于塞爾韋特對三位一體的立場，考慮他自己的陳述和他的教導的總結：
“基督與神不比聲音與說話的人或光與太陽分得更開﹝塞爾韋特寫到﹞。基督對于父神就如聲音對于說話的人。他與父就如光與太陽是同一個光。一個驚人的奧秘就是神因此可以與人相連，人與神相連。一個大奇事就是神以基督的身體為他的住所。”
順便說一下，有位早期教會先父也用了同樣的比擬來定義三位一體說：“神差道，就如保惠師也宣告的那樣，就如根產生樹，泉產生河，和太陽產生光。……即使當光從太陽發出時，光仍然是太陽的一部分﹔太陽仍在光中，因為那是太陽的光，光與太陽沒有分離，而是太陽的延伸。因此基督是靈的靈，神的神，光的光點燃了”特土良（Tertullian）
“我將承認這三件事：第一，這人是耶穌基督﹔第二，他是神的兒子﹔第三，他是神。”The two treatises of Servetus on the Trinity
“基督與父神為一，權能相同，從天降下，有了人的肉身。”基督，人子，從天而降，是神創造世界說的話。他作為神頭生的成為肉身，是神的兒子。他既有人性也有神性。移動萬物的神的靈在我們裏面作為聖靈運作，是神頭的一位。聖靈來自子，不是作為一個獨立的存在，而是作為一個事奉的靈。聖靈是聖潔的，神頭裏三位之一，通過住在我們裏面潔淨我們。
檢驗“神”這個詞在舊約裏的用法，אלהים和יהוה，顯示出兩個詞指的都是基督，作為萬物的中心，萬物的本質。
永恆的獨生子是神的道，神通過他使自己被知道。希伯來顯示神的全部性質都作為אלהים住在基督裏，神與人同在。道是神的一個安排，神生了子，一個可見的存在。聖靈也如基督是真實的存在。道是一個實在的存在，道創造了萬有，是神以肉身的形式表顯出來。
塞爾韋特也承認在這個問題上沒有寫得很清楚，因此他所寫的被誤解了，他為此在這裏道謙。他所表現出的態度遠比嗜血的加爾文的態度更像基督。
我後來在七本書裏寫的反對被大家接受的對三位一體的看法，誠實的讀者，我現在收回﹔不是因為我寫得不對，而是因為寫得不完整，好像一個小孩寫給小孩。然而，我禱告你保留它也許有助于你理解在這裏所說得的。還有，這本書是如此野蠻，混亂，不正確，像我以前的那本書一樣，一定是由于我缺乏經驗，和印刷者的疏忽。我也不希望任何基督徒因此而受到冒犯，因為神有時通過這個世界愚蠢的器皿使人知道神的智慧。因此，我求你們，關注事情的本身，因為如果你們留意這一點，我停頓的話不會妨礙你們。愿你們平安。
這裏神學上的困惑也許是因為塞爾韋特不是職業的神學家，而是一位醫生。因此，他用來描述神的神學詞匯也許與歸正神學家所使用的詞匯有不同的含意。特別地，在他的文章裏，他對“實體”（hypostasis）一詞的用法與神學家的用法不同。因為在醫學詞匯裏，“hypostasis”的意思是因為血液流動的減少，血液在器官或身體的下部沉積，或更廣泛的，指固體顆粒在流體中的沉降。但這個詞還有其它定義：
對于塞爾韋特來說，耶穌基督是神頭裏的唯一“hypostasis”，因為耶穌是唯一的外在表現，更多地使用了這個詞的醫學意義，就如光對于太陽一樣。因此，說三位一體中的每一位都是“hypostasis”對于塞爾韋特來說更像是在一個有三個頭的神，也就是三神論，他顯然拒絕承認。但我認為這是對神學術語的誤解，而不是對概念的不認同。
但加爾文太高傲和充滿敵意，不愿去理解塞爾韋特。而塞爾韋特缺乏對神學術語的了解，他在上面道歉表明他似乎明白了這一點。但為時已晚，加爾文要的是他的血，而不是道歉。
毫無疑問，塞爾韋特是基督徒，但控告他的人故意曲解他，對他進行不公的審判，為的是要謀殺他。他們不允許塞爾韋特有辯護律師，用冷酷的幽默告訴塞爾韋特，他不需要辯護律師就可以騙得很好，并且不允許他回答多項對他的指控。
事實上托馬斯﹒史密斯牧師在他的《加爾文和他的敵人》一書裏承認塞爾韋特被定罪并不是因為他的教義，而是因為他維護他的教義的方式。也就是說，他不是一個討人歡心的人， 說出自己觀點而不顧別人的感受，甚至以一種居高臨下，俗人的方式說話（就像耶穌那樣）。這樣，他就得罪了宗教精英（就像耶穌那樣），結果被定死罪，不是因為他的教義，而是因為他羞辱了高傲的人。然而很多加爾文主義者把責任推到塞爾韋特身上。柯銳奇（J. T. Coleridge）說：“如果有哪個可憐的狂熱分子把自己投入火中，那一定是米格爾﹒塞爾韋特。”而他們極力把約翰﹒加爾文說成是環境的受害者。
這并不是一個罕見的例子，甚至教會裏受歡迎的機構領袖最終也可能會犯下殘暴的罪行。因為他們的精英態度，他們無法忍受羞辱，因此甚至以嗜血的敵意作出反應。基督的死就是一個例子，塞爾韋特是另一個例子。